觀察水色要注意兩個管理要點：

1.色的變化

2.透明度的變化。

在色的顏色變化上是很容易了解，如同前述，不同的色代表不同的藻類甚至可以聯(lián)想到底質土壤的有機物量、殘餌量等。

但是在實務上，“色”是一種主觀認定，顏色也很容易被外在背景、光線、藻類濃度所影響。光線、背景這很容易了解，大太陽、陰天、早上、傍晚、逆光、背光，池子旁邊的植物….都會影響觀察者所觀察到的水色。況且不同藻類有不同顏色，但是深淺之間再加上有不同藻類時，就很難加以判斷到底是哪一種藻產(chǎn)生所謂的色，是我們要的水色。結果是對同一池水的色澤，每個人的形容詞都會不一樣，形成雞同鴨講的局面。為了避免大家對池水“色”的看法差異。實務上有些老師傅建議，早上清晨去觀察水色，是最具代表性，這一點是可以理解與認同的。在清晨時光線穩(wěn)定，藻類光合作用還沒開始旺盛，而這時候水中溶氧偏低，觀察水色時順便看看魚有沒有浮頭、貼近水車尾端，蝦子有沒有靠岸

（蝦子缺氧時會靠岸與魚類浮頭現(xiàn)象有很大不同）。

而不同養(yǎng)殖物種時，對水色的詮釋也有所不同。在養(yǎng)魚時，藻色深淺代表水中藻類濃度，當水色太濃時就要換水或是采取其他應變措施。但是在貝類養(yǎng)殖時，藻色的判斷就與貝類攝食有關，例如在蜆養(yǎng)殖的時候，矽藻與綠藻混合時水體看起來就有金黃色的感覺（如下圖所示）

如果以矽藻為主時，量較少時水色為紅棕色，但是量大時卻又變成濃咖啡色，這種色就很像渦鞭毛藻的色澤，因此以顏色作為完全的管理指標來說會有所缺憾，而解決的方法最好是用顯微鏡進行確認一下，是比較好的方式。